More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0101 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 
398 aa  811    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 
402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 
403 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.11 
 
 
409 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 
391 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  58.03 
 
 
414 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 
394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  56.52 
 
 
387 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 
440 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 
401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 
396 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 
409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 
386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 
402 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 
393 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.96 
 
 
396 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 
398 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  55.19 
 
 
400 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 
397 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 
397 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  58.12 
 
 
405 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 
402 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  55.05 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 
401 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 
391 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 
396 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 
406 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 
406 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 
434 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 
397 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 
396 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 
407 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  58.64 
 
 
454 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  55.41 
 
 
402 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 
432 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  54.15 
 
 
400 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 
397 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 
397 aa  431  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 
397 aa  431  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 
399 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 
399 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  56.4 
 
 
397 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 
410 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 
406 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 
399 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 
397 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 
397 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 
397 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  56.4 
 
 
404 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 
397 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 
431 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 
397 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  57.59 
 
 
412 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 
410 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 
397 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 
399 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 
397 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 
397 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 
403 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 
397 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  54.9 
 
 
406 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  56.28 
 
 
397 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  55.32 
 
 
397 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  54.85 
 
 
399 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 
397 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  52.96 
 
 
397 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  55.61 
 
 
402 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 
396 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 
397 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 
428 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  56.14 
 
 
397 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 
403 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 
397 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 
405 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 
397 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 
389 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  56.66 
 
 
397 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  53.21 
 
 
397 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 
389 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  52.96 
 
 
397 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  53.6 
 
 
425 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  54.55 
 
 
393 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 
397 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 
404 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1433  tryptophan synthase subunit beta  53.05 
 
 
404 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  56.1 
 
 
400 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 
401 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 
397 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  54.78 
 
 
411 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  56.02 
 
 
397 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  53.59 
 
 
401 aa  425  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  54.81 
 
 
394 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  56.4 
 
 
405 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  54.9 
 
 
411 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 
397 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>