More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3688 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  78.54 
 
 		 400 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 400 aa  824    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  91.23 
 
 		 402 aa  760    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  91.86 
 
 		 393 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  66 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  63.1 
 
 		 385 aa  504  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 400 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  59.54 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  60.93 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.82 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  59.25 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  59.25 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  59.75 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  61.42 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  56.44 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 395 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  55.16 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  55.14 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  53.25 
 
 		 401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 403 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  53.49 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  54.99 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  55.14 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 		 407 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  56.12 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  54.96 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  55.94 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  54.57 
 
 		 399 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  53.94 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  53.94 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  52.53 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  52.88 
 
 		 408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 		 406 aa  444  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  52.02 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  54.2 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  52.02 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  53.12 
 
 		 399 aa  441  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  53.96 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  53.2 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  53.94 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  52.21 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  52.27 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  53.69 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  53.79 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  52.21 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  53.89 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  52.51 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  55 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  51.99 
 
 		 410 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  51.91 
 
 		 406 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  54.48 
 
 		 414 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  52.51 
 
 		 406 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>