More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0583 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 403 aa  828    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  70.96 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  71.61 
 
 		 440 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  68.78 
 
 		 402 aa  565  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  69.74 
 
 		 382 aa  554  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 		 400 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 391 aa  478  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.52 
 
 		 409 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  59.17 
 
 		 402 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  59.7 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  59.8 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.76 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  59.15 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  59.05 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 394 aa  464  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 398 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 401 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  57.43 
 
 		 402 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.67 
 
 		 400 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 397 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  57.68 
 
 		 403 aa  464  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  59.69 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 391 aa  464  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  57.04 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 402 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 404 aa  461  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 407 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 409 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  57.73 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 402 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  58.76 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  56.79 
 
 		 406 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 400 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 406 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  55.97 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  56.1 
 
 		 424 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 396 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  59.27 
 
 		 399 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  55.9 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  56.1 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  56.62 
 
 		 415 aa  454  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  56.16 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 395 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  56.53 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  57.95 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0644  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  56.01 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  58.44 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>