More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0742 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 403 aa  832    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  75.51 
 
 		 403 aa  634    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  69.64 
 
 		 401 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  67.6 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  69.21 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  67.86 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  67.86 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  67 
 
 		 400 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  69.04 
 
 		 399 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  65.08 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  61.21 
 
 		 400 aa  501  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  60.41 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 408 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  54.78 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  54.78 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  54.88 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 391 aa  431  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  55.18 
 
 		 385 aa  425  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 399 aa  421  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 399 aa  421  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  53.65 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  53.37 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  53.61 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  53 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  51.8 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  50.51 
 
 		 449 aa  411  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  52.47 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  53.26 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  52.48 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  52.2 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  52.07 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 405 aa  408  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  52.36 
 
 		 414 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  51.02 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  53.26 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  52.2 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  51.02 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  51.65 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  51.94 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  51.52 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  51.02 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  48.75 
 
 		 402 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  51.83 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  52.63 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  52.31 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  51.52 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  51.55 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  51.67 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  51.7 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  50 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  50.77 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  51.44 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  51.03 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  51.65 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  50.64 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  52.99 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  49.49 
 
 		 414 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  51.41 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  51.04 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  51.17 
 
 		 394 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  52.21 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  50.89 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  51.44 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  48.75 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  50.52 
 
 		 403 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  50 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0695  tryptophan synthase subunit beta  50.5 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  50 
 
 		 409 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  49.49 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  50 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 397 aa  401  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  48.11 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  51.57 
 
 		 405 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>