More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0198 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  84.71 
 
 		 406 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 408 aa  833    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 400 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 402 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  59.38 
 
 		 403 aa  471  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  60.93 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 403 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  61.18 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  57.91 
 
 		 385 aa  465  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  60.54 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  57.82 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  53.47 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 409 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  56.05 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  54.59 
 
 		 391 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  53.59 
 
 		 401 aa  433  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  55.15 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  52.51 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 382 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  51.62 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  50.9 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  53.51 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  51.55 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  51.38 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  53.97 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  54.83 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  52.12 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  53.35 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  50 
 
 		 409 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  50.91 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  50.91 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  51.04 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  51.93 
 
 		 406 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  53.49 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  52.33 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  54.03 
 
 		 408 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  54.31 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  52.58 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  51.68 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  52.33 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  51.16 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  50.64 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  52.74 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  50.77 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  53 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  51.69 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  51.69 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  51.69 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  51.42 
 
 		 412 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  51.28 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  50.78 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  51.3 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0972  tryptophan synthase subunit beta  54.03 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  51.69 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  51.69 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  51.3 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  52.44 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  51.3 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  50.9 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  52.48 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  51.69 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  53.58 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  51.3 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  53.7 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  50.76 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  51.17 
 
 		 406 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  53.97 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  50.39 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  50.39 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  54.05 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  52.22 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  52.09 
 
 		 407 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  51.95 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  50.39 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  50.65 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  51.43 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  51.7 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  50.78 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  50.76 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>