More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0165 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 401 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  94.25 
 
 		 401 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 401 aa  818    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  72.68 
 
 		 400 aa  604  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  67.86 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  71.68 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 		 400 aa  551  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 407 aa  550  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  66.33 
 
 		 403 aa  547  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  59.25 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  61.28 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  59.48 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  53.67 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  54.19 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  52.91 
 
 		 409 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  53.63 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  52.36 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  52.56 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  53.69 
 
 		 395 aa  408  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  52.42 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  51.52 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  51.52 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  52.7 
 
 		 409 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  52.05 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  51.41 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  52.07 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  50.74 
 
 		 422 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  52.94 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  53.89 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  51.55 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  51.77 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  52.99 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  52.96 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  50.74 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  51.92 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4868  tryptophan synthase subunit beta  51.73 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  49.11 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  51.39 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  52.99 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  52.44 
 
 		 385 aa  398  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  51.01 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  49.11 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10970  tryptophan synthase subunit beta  50.25 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0274745  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 397 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  51.98 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1564  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  51.38 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  50.51 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  51.91 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  51.13 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  49.61 
 
 		 414 aa  393  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  50.25 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  51.98 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  50.5 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  50.38 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  49.87 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  50.92 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  49.62 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  50.13 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  51.53 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>