More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1564 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1564  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 406 aa  833    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1771  tryptophan synthase subunit beta  70.39 
 
 		 410 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 396 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 		 409 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  66.32 
 
 		 396 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  64.8 
 
 		 402 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  65.3 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.19 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 402 aa  524  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  64.8 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  63.73 
 
 		 391 aa  518  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  62.91 
 
 		 406 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  65.38 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  63.89 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  64.07 
 
 		 403 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  65.13 
 
 		 396 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  65.64 
 
 		 401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  64.69 
 
 		 403 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 		 397 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.41 
 
 		 409 aa  511  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  65.03 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 		 395 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  65.03 
 
 		 403 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  64.69 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  65.72 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  65.72 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  64.12 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  63.2 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 397 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  64.43 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 397 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  62.86 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 405 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  61.36 
 
 		 409 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  63.1 
 
 		 412 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  62.09 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 406 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  63.5 
 
 		 406 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  62.12 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 399 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  64.69 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  63.4 
 
 		 401 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  60.25 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  62.98 
 
 		 400 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  63.31 
 
 		 406 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  61.58 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.07 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  63.97 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  62.34 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  63.24 
 
 		 402 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  62.98 
 
 		 406 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  60.56 
 
 		 414 aa  500  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 		 406 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  61.28 
 
 		 406 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  63.4 
 
 		 403 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  64.46 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  61.54 
 
 		 447 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  63.05 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  64.51 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  64.46 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  64.46 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>