More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1700 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 407 aa  843    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  67.6 
 
 		 403 aa  580  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  68.77 
 
 		 403 aa  578  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 		 400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 401 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  65.91 
 
 		 401 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  64.57 
 
 		 400 aa  547  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  64.91 
 
 		 401 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  65.66 
 
 		 399 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  64.19 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  62.72 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 400 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  59.6 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  57.84 
 
 		 406 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.52 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  55.08 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  55.08 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  54.59 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  54.64 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  55.44 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  54.99 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  58.19 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  54.85 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  54.18 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  52.67 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  56.6 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  54.48 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  52.96 
 
 		 414 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  55.38 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  54.82 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  53.44 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  56.69 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  53.39 
 
 		 394 aa  428  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  54.57 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  53.39 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  52.15 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  54.31 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  53.67 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  51.86 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  53.96 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  52.96 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  54.92 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  55.03 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  52.79 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  53.81 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  53.67 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  53.87 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  54.31 
 
 		 407 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  53.52 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  53.02 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 403 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  52.51 
 
 		 405 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  51.61 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  52.86 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0728  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  53.89 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  53.55 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 425 aa  418  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  52.3 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  54.12 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  52.86 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  53.08 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>