More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0551 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 412 aa  841    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 402 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 400 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 393 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  62.22 
 
 		 407 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  59.49 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  57.82 
 
 		 408 aa  478  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 409 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  56.99 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  54.99 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 402 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  58.19 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  59.08 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  55.27 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  58.14 
 
 		 403 aa  451  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  53.09 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  55.1 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 401 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  54.73 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  54.73 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  55.38 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  54.59 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  55.01 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  55.08 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  52.84 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  55.27 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  56.17 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  54.24 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  52.56 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  54.76 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  54.5 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  52.93 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  56.27 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  52.28 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  53.69 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  52.58 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  56.48 
 
 		 398 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  53.94 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  54.08 
 
 		 399 aa  438  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  53.02 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  52.59 
 
 		 410 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 396 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  55.3 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  54.48 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  52.32 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  54.1 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  52.76 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  52.9 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  53.11 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  53.15 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  54.94 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  52.54 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  52.06 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  51.79 
 
 		 404 aa  431  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  54.94 
 
 		 397 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  51.78 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  56.87 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  55.44 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  52.33 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  54.94 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  50 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  54.31 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  54.83 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  53.73 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11628  tryptophan synthase subunit beta  52.12 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246172 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  52.9 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  51.89 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  52.76 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  52.04 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>