More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3305 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3305  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 393 aa  808    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.980643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  71.69 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0972  tryptophan synthase subunit beta  71.98 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0353  tryptophan synthase subunit beta  71.21 
 
 		 393 aa  559  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1274  tryptophan synthase subunit beta  71.98 
 
 		 393 aa  556  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.545932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0397  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 		 392 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.256556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0372  tryptophan synthase subunit beta  64.86 
 
 		 392 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  61.88 
 
 		 391 aa  494  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1611  tryptophan synthase subunit beta  64.6 
 
 		 392 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 397 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  60.68 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  60.58 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  58.87 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  59.47 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  59.18 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 409 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  58.93 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  60.62 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  58.76 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  57.72 
 
 		 412 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.95 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  58.27 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1321  tryptophan synthase subunit beta  60.38 
 
 		 373 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000135158 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 404 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  57.66 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 413 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 394 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.14 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.21 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.47 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 411 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0942  tryptophan synthase subunit beta  58.68 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 396 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 393 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  58.03 
 
 		 401 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  59.27 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  55.47 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 396 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 405 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  57.89 
 
 		 403 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 400 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 403 aa  454  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>