More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1611 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0397  tryptophan synthase subunit beta  97.7 
 
 		 392 aa  755    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.256556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0372  tryptophan synthase subunit beta  97.7 
 
 		 392 aa  755    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1611  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 392 aa  798    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1345  tryptophan synthase subunit beta  78.97 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.259288  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0972  tryptophan synthase subunit beta  70.77 
 
 		 393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119472  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1274  tryptophan synthase subunit beta  70.84 
 
 		 393 aa  558  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.545932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  67.1 
 
 		 454 aa  552  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0353  tryptophan synthase subunit beta  71.03 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3305  tryptophan synthase, beta subunit  64.6 
 
 		 393 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.980643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 411 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  59.89 
 
 		 391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  56.14 
 
 		 409 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  54.69 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 395 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  60.21 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  55.06 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  54.81 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  53.75 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  55.09 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  55.81 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  56.28 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  55.84 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 414 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 414 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  56.28 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 415 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  58.33 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  56.14 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  52.97 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  54.31 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  54.81 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  54.97 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 414 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  54.2 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  54.9 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  54.19 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  54.92 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  53.68 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  53.93 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  55.38 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  55.09 
 
 		 416 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  53.93 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  53.68 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  53.77 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  54.36 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  54.36 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  54.36 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  53.77 
 
 		 407 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  54.78 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  56.12 
 
 		 401 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  53.77 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  54.35 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  53.7 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  55.12 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  53.51 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  53.79 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  53.77 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  53.25 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  52.71 
 
 		 413 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  53.26 
 
 		 396 aa  434  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  53.91 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  54.33 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  51.67 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  54.81 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  53.4 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  53.68 
 
 		 409 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  53.4 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>