More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1274 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1274  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 393 aa  803    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.545932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  76.61 
 
 		 454 aa  620  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0972  tryptophan synthase subunit beta  77.1 
 
 		 393 aa  615  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0353  tryptophan synthase subunit beta  77.1 
 
 		 393 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3305  tryptophan synthase, beta subunit  71.98 
 
 		 393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.980643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0397  tryptophan synthase subunit beta  71.87 
 
 		 392 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.256556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0372  tryptophan synthase subunit beta  71.87 
 
 		 392 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1611  tryptophan synthase subunit beta  70.84 
 
 		 392 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1345  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 		 391 aa  495  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.259288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  61.82 
 
 		 409 aa  488  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 394 aa  471  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  60.95 
 
 		 391 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  59.02 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.95 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 414 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.95 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  57.72 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  58.51 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 416 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  57.69 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 415 aa  454  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.59 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  55.61 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  56.15 
 
 		 401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  57.96 
 
 		 399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  58.68 
 
 		 398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  56.59 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  54.43 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 401 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 395 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  56.77 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2098  tryptophan synthase subunit beta  56.14 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  57.37 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0480  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  56.51 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  57.07 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1349  tryptophan synthase, beta subunit  55.93 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  55.81 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  55.53 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  55.53 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 410 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 406 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  56.58 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  54.19 
 
 		 411 aa  434  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  58.7 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>