More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1345 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1345  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 391 aa  794    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.259288  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0397  tryptophan synthase subunit beta  79.23 
 
 		 392 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.256556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0372  tryptophan synthase subunit beta  79.23 
 
 		 392 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1611  tryptophan synthase subunit beta  78.97 
 
 		 392 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  65.98 
 
 		 454 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0972  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0353  tryptophan synthase subunit beta  67.77 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1274  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.545932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3305  tryptophan synthase, beta subunit  61.03 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.980643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  59.53 
 
 		 391 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.59 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  56.25 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  57.54 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  57.36 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1176  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 395 aa  454  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.833361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  55.21 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  54.97 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  55.76 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3843  tryptophan synthase subunit beta  56.7 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  53.98 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  55.76 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  58.42 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  55.26 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  54.95 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  56.15 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  59.06 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  55.76 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 389 aa  441  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  53.93 
 
 		 403 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 417 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  53.91 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  54.9 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  54.34 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  54.17 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  53.23 
 
 		 413 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 389 aa  441  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  53.66 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  55.26 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  54.47 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  53.95 
 
 		 398 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  53.66 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  53.16 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  55.26 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  55.26 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  53.16 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  52.56 
 
 		 406 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  52.66 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  52.37 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  56.1 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  55.84 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  55.84 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  54.43 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  55.85 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  54.87 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  52.08 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1349  tryptophan synthase, beta subunit  56.4 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106047 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  53.4 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  50.88 
 
 		 435 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  55.84 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  54.21 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  54.05 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01931  tryptophan synthase subunit beta  55.09 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  53.09 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  56.1 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  51.66 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  54.09 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  52.66 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  56.1 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  53.66 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  53.35 
 
 		 394 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3218  tryptophan synthase subunit beta  55.7 
 
 		 394 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  51.65 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>