More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2159 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1782  tryptophan synthase subunit beta  70.76 
 
 		 454 aa  687    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1459  tryptophan synthase subunit beta  95.79 
 
 		 452 aa  870    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2159  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 452 aa  928    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3714  tryptophan synthase subunit beta  69.87 
 
 		 454 aa  681    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1328  tryptophan synthase subunit beta  70 
 
 		 456 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0699  tryptophan synthase subunit beta  69.64 
 
 		 454 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2123  tryptophan synthase subunit beta  84.92 
 
 		 453 aa  780    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0402624  hitchhiker  0.00258343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1751  tryptophan synthase subunit beta  70.8 
 
 		 454 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1642  tryptophan synthase subunit beta  68.96 
 
 		 454 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1294  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  68.35 
 
 		 457 aa  643    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1594  tryptophan synthase subunit beta  75.5 
 
 		 453 aa  708    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3063  tryptophan synthase subunit beta  69.2 
 
 		 452 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1286  tryptophan synthase subunit beta  68.6 
 
 		 470 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1979  tryptophan synthase subunit beta  67.85 
 
 		 452 aa  634  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1259  tryptophan synthase subunit beta  65.63 
 
 		 450 aa  632  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3865  tryptophan synthase subunit beta  63.72 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0495522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3748  tryptophan synthase subunit beta  63.47 
 
 		 451 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3889  tryptophan synthase subunit beta  63.25 
 
 		 451 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3805  tryptophan synthase subunit beta  63.03 
 
 		 451 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3218  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  69.77 
 
 		 442 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0305  tryptophan synthase subunit beta  63.7 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0031  tryptophan synthase subunit beta  62.92 
 
 		 451 aa  599  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1671  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  66.67 
 
 		 453 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032763  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1773  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 		 450 aa  596  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1277  tryptophan synthase subunit beta  62.19 
 
 		 450 aa  597  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000000682618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2493  tryptophan synthase subunit beta  62.58 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2379  tryptophan synthase subunit beta  62.14 
 
 		 451 aa  589  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1293  tryptophan synthase subunit beta  60.44 
 
 		 451 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1213  tryptophan synthase subunit beta  61.25 
 
 		 451 aa  589  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1735  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 450 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2258  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 451 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1958  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0558  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 		 452 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0070  tryptophan synthase subunit beta  60.4 
 
 		 452 aa  579  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.531769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3654  tryptophan synthase subunit beta  61.23 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.142399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0644  tryptophan synthase subunit beta  59.6 
 
 		 453 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0171484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0346  tryptophan synthase subunit beta  61.97 
 
 		 452 aa  579  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.344274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1035  tryptophan synthase subunit beta  63.72 
 
 		 454 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00331914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_905  pyridoxal-phosphate dependent tryptophan synthase-like protein  63.36 
 
 		 455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0593  tryptophan synthase subunit beta  64.35 
 
 		 452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0356  tryptophan synthase subunit beta  61.35 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.24 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000141811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0917  tryptophan synthase subunit beta  63.13 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3675  tryptophan synthase subunit beta  67.82 
 
 		 404 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1100  tryptophan synthase subunit beta  59.35 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.234808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0327  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2085  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 		 451 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000026544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0662  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 452 aa  564  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  60.35 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1205  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 		 451 aa  565  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1707  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  63.93 
 
 		 451 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0063  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 452 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.636154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3503  tryptophan synthase subunit beta  59.4 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.385411  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0398  tryptophan synthase subunit beta  65.23 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0473085  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0816  tryptophan synthase subunit beta  62 
 
 		 441 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299297 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0382  tryptophan synthase subunit beta  64.99 
 
 		 422 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.468203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0451  tryptophan synthase subunit beta  59.78 
 
 		 457 aa  557  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2404  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 453 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0890  tryptophan synthase subunit beta  60.76 
 
 		 460 aa  551  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0331  tryptophan synthase subunit beta  60.67 
 
 		 454 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.869557 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0256  tryptophan synthase subunit beta  60.22 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2615  tryptophan synthase subunit beta  60.18 
 
 		 457 aa  547  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2074  tryptophan synthase subunit beta  58.47 
 
 		 458 aa  541  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1633  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  66.75 
 
 		 436 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.213462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2450  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 454 aa  542  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.896091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0335  tryptophan synthase subunit beta  58.88 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3175  tryptophan synthase subunit beta  60.24 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752664  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1929  tryptophan synthase subunit beta  59.78 
 
 		 455 aa  531  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2923  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869971  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2591  tryptophan synthase subunit beta  61.05 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2635  tryptophan synthase subunit beta  61.05 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.429999  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1139  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  62.19 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.802779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3949  tryptophan synthase subunit beta  60.8 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.334602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2628  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0861  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4783  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  59.19 
 
 		 433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1225  tryptophan synthase subunit beta  52.88 
 
 		 461 aa  494  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.524383  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2020  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000317407 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0725  tryptophan synthase subunit beta  57.31 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000155508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3172  tryptophan synthase subunit beta  52.02 
 
 		 458 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000340613  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1254  tryptophan synthase subunit beta  57.72 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181406  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1028  tryptophan synthase subunit beta  56.26 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992034  normal  0.0454913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00500  tryptophan synthase subunit beta  50.33 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1870  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  48.94 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1691  tryptophan synthase subunit beta  48.81 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.248453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1206  tryptophan synthase subunit beta  51.69 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1418  tryptophan synthase subunit beta  51.31 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.955959  normal  0.212378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2529  tryptophan synthase subunit beta  47.53 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1916  tryptophan synthase subunit beta  51.21 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.315987  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1176  tryptophan synthase subunit beta  50.72 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.541584  normal  0.191375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1046  tryptophan synthase subunit beta  50 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.931659  hitchhiker  0.0000000138833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2532  tryptophan synthase subunit beta  45.41 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2113  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  44.5 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0990  tryptophan synthase subunit beta  45.86 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2012  tryptophan synthase subunit beta  42.19 
 
 		 440 aa  333  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.909029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3061  tryptophan synthase subunit beta  40.27 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135575  hitchhiker  0.00104829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0678  tryptophan synthase subunit beta  41.57 
 
 		 446 aa  300  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0544758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  34.32 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  32.63 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  32.63 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>