More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3061 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3061  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 447 aa  906    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135575  hitchhiker  0.00104829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0678  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0544758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2379  tryptophan synthase subunit beta  44.34 
 
 		 451 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20256  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1259  tryptophan synthase subunit beta  43.87 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000240862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2493  tryptophan synthase subunit beta  43.63 
 
 		 451 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1328  tryptophan synthase subunit beta  42.34 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2258  tryptophan synthase subunit beta  41.31 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1958  tryptophan synthase subunit beta  41.76 
 
 		 451 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3889  tryptophan synthase subunit beta  41.74 
 
 		 451 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3805  tryptophan synthase subunit beta  41.53 
 
 		 451 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3748  tryptophan synthase subunit beta  41.53 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1213  tryptophan synthase subunit beta  40.32 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1735  tryptophan synthase subunit beta  41.4 
 
 		 450 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0031  tryptophan synthase subunit beta  41.51 
 
 		 451 aa  325  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1293  tryptophan synthase subunit beta  41.75 
 
 		 451 aa  325  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1211  tryptophan synthase subunit beta  40.77 
 
 		 454 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000141811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3865  tryptophan synthase subunit beta  41.22 
 
 		 452 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0495522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0305  tryptophan synthase subunit beta  42.47 
 
 		 450 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3218  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  44.9 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1100  tryptophan synthase subunit beta  38.82 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.234808  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1782  tryptophan synthase subunit beta  40.86 
 
 		 454 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1594  tryptophan synthase subunit beta  41.67 
 
 		 453 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1773  tryptophan synthase subunit beta  40.8 
 
 		 450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1294  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  41.76 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0890  tryptophan synthase subunit beta  42.43 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1254  tryptophan synthase subunit beta  42.32 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1205  tryptophan synthase subunit beta  42.86 
 
 		 451 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3654  tryptophan synthase subunit beta  40.86 
 
 		 454 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.142399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2123  tryptophan synthase subunit beta  44.44 
 
 		 453 aa  312  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0402624  hitchhiker  0.00258343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0327  tryptophan synthase subunit beta  40.9 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3949  tryptophan synthase subunit beta  44.67 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.334602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2085  tryptophan synthase subunit beta  42.2 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000026544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2404  tryptophan synthase subunit beta  39.64 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1642  tryptophan synthase subunit beta  41.31 
 
 		 454 aa  310  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3063  tryptophan synthase subunit beta  40.05 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0398  tryptophan synthase subunit beta  41.83 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0473085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1671  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  44.73 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  40.72 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1277  tryptophan synthase subunit beta  40.42 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000000682618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0382  tryptophan synthase subunit beta  41.59 
 
 		 422 aa  306  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.468203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2159  tryptophan synthase subunit beta  41.87 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3714  tryptophan synthase subunit beta  39.95 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0816  tryptophan synthase subunit beta  43.06 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3503  tryptophan synthase subunit beta  37.91 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.385411  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_002936  DET1035  tryptophan synthase subunit beta  40.79 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00331914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2450  tryptophan synthase subunit beta  39.62 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.896091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4783  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  43.56 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1225  tryptophan synthase subunit beta  40.45 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.524383  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_905  pyridoxal-phosphate dependent tryptophan synthase-like protein  40.54 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205242  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0063  tryptophan synthase subunit beta  39.25 
 
 		 452 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.636154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3172  tryptophan synthase subunit beta  38.18 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000340613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1751  tryptophan synthase subunit beta  40.65 
 
 		 454 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0662  tryptophan synthase subunit beta  39.16 
 
 		 452 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1459  tryptophan synthase subunit beta  42.22 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0917  tryptophan synthase subunit beta  40.29 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243101  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0256  tryptophan synthase subunit beta  39.15 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1916  tryptophan synthase subunit beta  44.44 
 
 		 420 aa  299  6e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.315987  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0644  tryptophan synthase subunit beta  39.53 
 
 		 453 aa  298  9e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0171484  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0070  tryptophan synthase subunit beta  40.36 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.531769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0331  tryptophan synthase subunit beta  40.31 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.869557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00500  tryptophan synthase subunit beta  38.57 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1206  tryptophan synthase subunit beta  44.44 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3675  tryptophan synthase subunit beta  43.81 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0335  tryptophan synthase subunit beta  40.43 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1707  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  43.6 
 
 		 451 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0593  tryptophan synthase subunit beta  43.6 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1028  tryptophan synthase subunit beta  42.82 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992034  normal  0.0454913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0861  tryptophan synthase subunit beta  38.24 
 
 		 455 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302505  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1286  tryptophan synthase subunit beta  40.72 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0725  tryptophan synthase subunit beta  39.76 
 
 		 418 aa  293  6e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000155508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0699  tryptophan synthase subunit beta  38.01 
 
 		 454 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1176  tryptophan synthase subunit beta  44.79 
 
 		 418 aa  292  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.541584  normal  0.191375 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2020  tryptophan synthase subunit beta  43.62 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000317407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1979  tryptophan synthase subunit beta  40.53 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1139  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  46.61 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.802779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2074  tryptophan synthase subunit beta  38.26 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2615  tryptophan synthase subunit beta  39.19 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3175  tryptophan synthase subunit beta  43.29 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752664  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0356  tryptophan synthase subunit beta  37.03 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0451  tryptophan synthase subunit beta  37.8 
 
 		 457 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1929  tryptophan synthase subunit beta  38.96 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0558  tryptophan synthase subunit beta  37.16 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2529  tryptophan synthase subunit beta  37.06 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2628  tryptophan synthase subunit beta  42.42 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2923  tryptophan synthase subunit beta  42.42 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869971  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1418  tryptophan synthase subunit beta  42.86 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.955959  normal  0.212378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2591  tryptophan synthase subunit beta  42.42 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2635  tryptophan synthase subunit beta  42.42 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.429999  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0346  tryptophan synthase subunit beta  38.56 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.344274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2532  tryptophan synthase subunit beta  39.15 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1691  tryptophan synthase subunit beta  40.73 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.248453 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1046  tryptophan synthase subunit beta  43.19 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.931659  hitchhiker  0.0000000138833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2012  tryptophan synthase subunit beta  38.33 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.909029  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1870  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  39.06 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2113  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  38.1 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1633  pyridoxal-phosphate dependent TrpB-like enzyme  40.57 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.213462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0990  tryptophan synthase subunit beta  40 
 
 		 435 aa  252  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  32.13 
 
 		 723 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  32.58 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2054  tryptophan synthase, beta subunit  32.19 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>