More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0271 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0271  primosomal protein N'  100 
 
 		 841 aa  1635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0035  primosomal protein N'  36.39 
 
 		 732 aa  363  7.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3001  primosomal protein N'  35.79 
 
 		 723 aa  312  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380738  normal  0.338473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  24.57 
 
 		 745 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  25.39 
 
 		 802 aa  217  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  27.49 
 
 		 796 aa  217  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  31.6 
 
 		 786 aa  217  8e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  28.79 
 
 		 810 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  27.88 
 
 		 781 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  24.76 
 
 		 732 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  29.5 
 
 		 810 aa  210  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  31.24 
 
 		 770 aa  208  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  27.34 
 
 		 813 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  25.97 
 
 		 802 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  25.97 
 
 		 802 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  31.68 
 
 		 810 aa  207  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  33.47 
 
 		 821 aa  206  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  26.31 
 
 		 798 aa  204  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  27.76 
 
 		 809 aa  203  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  31.61 
 
 		 848 aa  203  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  28.82 
 
 		 812 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  31.54 
 
 		 835 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  32.77 
 
 		 733 aa  202  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  30.81 
 
 		 679 aa  201  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  26.29 
 
 		 804 aa  201  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  29.01 
 
 		 749 aa  201  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  28.94 
 
 		 824 aa  200  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  31.61 
 
 		 758 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  30 
 
 		 802 aa  200  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  31.52 
 
 		 729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  29.55 
 
 		 914 aa  198  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  29.33 
 
 		 835 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  26.82 
 
 		 803 aa  197  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  32.22 
 
 		 780 aa  197  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  28.47 
 
 		 801 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  31.12 
 
 		 730 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  26.76 
 
 		 747 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  31.12 
 
 		 730 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  32.64 
 
 		 732 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  31.09 
 
 		 732 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  31.43 
 
 		 727 aa  194  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  26.89 
 
 		 730 aa  194  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  32.62 
 
 		 725 aa  194  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  26.57 
 
 		 798 aa  194  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  25.71 
 
 		 660 aa  194  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  31.68 
 
 		 828 aa  194  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  30.68 
 
 		 725 aa  194  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  29.88 
 
 		 738 aa  193  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  32.71 
 
 		 733 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  30.72 
 
 		 730 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  29.83 
 
 		 858 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  29.79 
 
 		 735 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  25.14 
 
 		 818 aa  191  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  28.65 
 
 		 811 aa  191  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  27.71 
 
 		 735 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  28.87 
 
 		 843 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  30.53 
 
 		 849 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  31.71 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  30.43 
 
 		 735 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1430  primosomal protein N'  27.57 
 
 		 764 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0145325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  25.8 
 
 		 661 aa  188  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  28.33 
 
 		 732 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  32.39 
 
 		 806 aa  188  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  30.19 
 
 		 825 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  29.93 
 
 		 744 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  24.7 
 
 		 724 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  31.59 
 
 		 744 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  28.13 
 
 		 815 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  29.89 
 
 		 745 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  29.05 
 
 		 752 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  30.17 
 
 		 744 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  22.81 
 
 		 815 aa  185  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  32.24 
 
 		 739 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  26.86 
 
 		 815 aa  185  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  30.05 
 
 		 740 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  29.13 
 
 		 735 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  29.05 
 
 		 752 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  28.04 
 
 		 695 aa  184  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  32.02 
 
 		 739 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  30.56 
 
 		 739 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  22.22 
 
 		 790 aa  183  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  31.76 
 
 		 866 aa  183  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  27.33 
 
 		 803 aa  183  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  28.6 
 
 		 815 aa  182  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  32.02 
 
 		 739 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  27.43 
 
 		 815 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  25.52 
 
 		 801 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2694  transcription elongation factor GreA / replication restart DNA helicase PriA  28.38 
 
 		 736 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000288054  hitchhiker  0.00453215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  31.82 
 
 		 746 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  28.63 
 
 		 731 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  29.37 
 
 		 774 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  25.14 
 
 		 801 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  30.33 
 
 		 739 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  29.63 
 
 		 745 aa  182  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  24.86 
 
 		 801 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  30.27 
 
 		 751 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  24.6 
 
 		 801 aa  180  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  24.6 
 
 		 801 aa  180  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  24.68 
 
 		 801 aa  180  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  24.68 
 
 		 801 aa  180  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>