More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3001 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0035  primosomal protein N'  62.94 
 
 		 732 aa  860    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3001  primosomal protein N'  100 
 
 		 723 aa  1411    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380738  normal  0.338473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0271  primosomal protein N'  34.96 
 
 		 841 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  26.67 
 
 		 809 aa  210  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  26.84 
 
 		 781 aa  207  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  28.63 
 
 		 749 aa  195  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  28.57 
 
 		 802 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  28.6 
 
 		 804 aa  190  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  27.58 
 
 		 914 aa  183  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  25.31 
 
 		 831 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  30.15 
 
 		 836 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  29.12 
 
 		 738 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  28.26 
 
 		 738 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  28.48 
 
 		 747 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  24.8 
 
 		 745 aa  180  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2694  transcription elongation factor GreA / replication restart DNA helicase PriA  25.73 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000288054  hitchhiker  0.00453215 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  23.81 
 
 		 796 aa  179  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  28.84 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  28.48 
 
 		 738 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  29.68 
 
 		 729 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  29.88 
 
 		 810 aa  178  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  28.28 
 
 		 825 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  30.18 
 
 		 810 aa  177  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  29.82 
 
 		 735 aa  177  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  28.45 
 
 		 835 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  25.31 
 
 		 798 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  26.56 
 
 		 813 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  28.36 
 
 		 730 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  24.71 
 
 		 798 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  27.7 
 
 		 848 aa  174  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  26 
 
 		 660 aa  174  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  27.44 
 
 		 849 aa  174  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  29.54 
 
 		 733 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  28.36 
 
 		 730 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  28.27 
 
 		 732 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  28.38 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  26.69 
 
 		 824 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  28.7 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  28.98 
 
 		 732 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  27.59 
 
 		 843 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  28.99 
 
 		 835 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  30.43 
 
 		 732 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  28.62 
 
 		 733 aa  171  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  28.98 
 
 		 732 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  28.8 
 
 		 732 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  28.85 
 
 		 732 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1430  primosomal protein N'  22.72 
 
 		 764 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0145325  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  26.2 
 
 		 803 aa  170  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  27.26 
 
 		 740 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  28.12 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  26.13 
 
 		 731 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  26 
 
 		 724 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  28.45 
 
 		 828 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  30.28 
 
 		 866 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  28.5 
 
 		 725 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  27.22 
 
 		 803 aa  167  6.9999999999999995e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  28.1 
 
 		 736 aa  167  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  27.39 
 
 		 733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  27.64 
 
 		 746 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  26.62 
 
 		 753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  26.96 
 
 		 804 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  26 
 
 		 731 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  25.87 
 
 		 731 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  27.46 
 
 		 751 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  27.12 
 
 		 769 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  25.79 
 
 		 775 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  26.84 
 
 		 734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  23.93 
 
 		 802 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  23.93 
 
 		 802 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  29.22 
 
 		 814 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  22.89 
 
 		 801 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  27.02 
 
 		 739 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0248  primosomal protein N'  29.68 
 
 		 731 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000476665  normal  0.18889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  28.13 
 
 		 738 aa  165  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  25.54 
 
 		 780 aa  164  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  28.35 
 
 		 745 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  25.7 
 
 		 801 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  28.03 
 
 		 725 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  25.35 
 
 		 732 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  29.69 
 
 		 806 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  25.74 
 
 		 731 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  25.45 
 
 		 731 aa  164  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  25.5 
 
 		 801 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  26.91 
 
 		 733 aa  164  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  28.7 
 
 		 739 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  27.94 
 
 		 727 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  29.3 
 
 		 739 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  26.22 
 
 		 737 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  23.24 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  23.24 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  25.3 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  23.24 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  23.24 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  29.3 
 
 		 739 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  25.3 
 
 		 801 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  28.98 
 
 		 739 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  28.62 
 
 		 732 aa  161  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  27.86 
 
 		 725 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  27.31 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  29.33 
 
 		 774 aa  161  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>