More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1874 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1874  response regulator receiver protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2239  response regulator receiver protein  65.64 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  hitchhiker  0.0000034786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  34.02 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  32.18 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4196  response regulator receiver domain-containing protein  31.52 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2708  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18523  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0451  response regulator receiver protein  30.57 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  23.83 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 1725 aa  68.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 1725 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 1022 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  20.53 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  36.07 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  31.5 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  22.84 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  36.07 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  35.83 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  35.83 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 1609 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2462  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  35.83 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.75 
 
 		 2301 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 2212 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.92 
 
 		 1989 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0839  DNA binding domain-containing protein  28.22 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 2012 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  36.07 
 
 		 258 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  30.83 
 
 		 1834 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 122 aa  62  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 934 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  22.73 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1344 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 2009 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  33.33 
 
 		 1361 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  30.48 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.66 
 
 		 1414 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  21.67 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  32.08 
 
 		 1987 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.05 
 
 		 1960 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  29.51 
 
 		 2458 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  61.9 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 1629 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  29.51 
 
 		 2476 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 1832 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.4 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  29.41 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  21.9 
 
 		 1335 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.4 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  29.13 
 
 		 2048 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.97 
 
 		 1866 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0587  excisionase/Xis, DNA-binding  55.32 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2670  excisionase/Xis, DNA-binding  55.32 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  26.61 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  25.81 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2287  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0246688  normal  0.814678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 1077 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 945 aa  58.2  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3484  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180993  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  25.58 
 
 		 1374 aa  58.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 1646 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.19 
 
 		 1992 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.2 
 
 		 1956 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.64 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4236  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.37 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  31.43 
 
 		 121 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 121 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 397 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 1646 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 1647 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  28.12 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1636  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.25 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  26.72 
 
 		 1347 aa  56.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2453  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  29.75 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1981  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03493  response regulator  21.13 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>