More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2708 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2708  response regulator receiver protein  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0562  excisionase/Xis, DNA-binding  51.83 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4196  response regulator receiver domain-containing protein  41.92 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0451  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5042  excisionase/Xis, DNA-binding  38.01 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  33.5 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2239  response regulator receiver protein  29.61 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  hitchhiker  0.0000034786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1282  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.546653  hitchhiker  0.0000171742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0587  excisionase/Xis, DNA-binding  28.19 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1874  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0839  DNA binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  28.79 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2540  response regulator  30.17 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2670  excisionase/Xis, DNA-binding  29.26 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  28.02 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  27.52 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  22.16 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0035  response regulator receiver protein  35.05 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2404  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 119 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  28.07 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.88 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0726  response regulator receiver protein  32.63 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0435  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.583358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4207  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.771701  normal  0.140814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1002 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 1003 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.96 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03493  response regulator  25.65 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  24.87 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.38 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 		 991 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1383 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  29.77 
 
 		 1686 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0855  DNA-binding response regulator  23.68 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0365807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  30 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1537  response regulator receiver protein  23.37 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 870 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  29.77 
 
 		 736 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  33.72 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.23 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1681 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1681 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.15 
 
 		 720 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  35.61 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 679 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  27.56 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 541 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  28.57 
 
 		 1343 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 823 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1054  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.75 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 1352 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 632 aa  55.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3384  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.52 
 
 		 829 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  36.9 
 
 		 846 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 1010 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  27.91 
 
 		 469 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  32.03 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  28.24 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  29.68 
 
 		 1834 aa  55.1  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0230  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  28.24 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  26.45 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.71 
 
 		 1020 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 406 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 395 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  28.93 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 541 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 386 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  39.18 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.3 
 
 		 461 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 460 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 376 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0081  two component transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 399 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0981  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  29.77 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.66 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>