More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4207 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4207  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  238  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.771701  normal  0.140814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0035  response regulator receiver protein  98.33 
 
 		 120 aa  234  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2404  response regulator receiver protein  82.05 
 
 		 119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0726  response regulator receiver protein  75.63 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 390 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  45.3 
 
 		 235 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 235 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  45.3 
 
 		 235 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 235 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  45.3 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  45.3 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  45.3 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  45.3 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  45.3 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  45.3 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  45.3 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 255 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 278 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  43.8 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 236 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 243 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.17 
 
 		 236 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 369 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 228 aa  89.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 233 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 237 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  41.03 
 
 		 1127 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  38.14 
 
 		 356 aa  89.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.5 
 
 		 427 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 236 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 367 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.52 
 
 		 457 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 806 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  41.23 
 
 		 248 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  40.5 
 
 		 705 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  45.83 
 
 		 230 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.83 
 
 		 310 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 229 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.54 
 
 		 326 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 229 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  42.62 
 
 		 461 aa  87.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  42.62 
 
 		 456 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 236 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.89 
 
 		 454 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 235 aa  87  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  37.82 
 
 		 285 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 239 aa  86.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  36.89 
 
 		 460 aa  86.3  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  40.5 
 
 		 705 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.68 
 
 		 715 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 247 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.03 
 
 		 229 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 244 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  35.9 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  39.32 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 243 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  39.47 
 
 		 248 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.67 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  38.6 
 
 		 248 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 317 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.86 
 
 		 703 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 248 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 242 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 236 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  43.36 
 
 		 290 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  36.07 
 
 		 454 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  39.82 
 
 		 246 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  43.59 
 
 		 233 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  42.37 
 
 		 969 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  41.67 
 
 		 462 aa  84.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.07 
 
 		 1177 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 242 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 242 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 237 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 233 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 231 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  41.8 
 
 		 461 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 270 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  43.59 
 
 		 233 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 231 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 232 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 246 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  43.7 
 
 		 326 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 237 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 492 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  40.68 
 
 		 382 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  38.46 
 
 		 235 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 236 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>