69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1712 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 140 aa  276  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  55.56 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  50 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  47.45 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  47.45 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  48.46 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  45.74 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  48.84 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  38.06 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  36.3 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  38.97 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  34.59 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  36.03 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  32.12 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  34.81 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  54.24 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  34.85 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  33.57 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  33.82 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  32.84 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  28.76 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  36.3 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  34.56 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  32.14 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30.71 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  31.72 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  32.11 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  34.81 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  30.07 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  28.68 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  34.78 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  27.86 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  27.13 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  27.43 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  30 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  30 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  27.91 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  32.73 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  30.25 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  28.81 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  25.74 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  28.87 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  28.26 
 
 		 163 aa  43.5  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  28.38 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  28.38 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  30 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  31.4 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  31.4 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  27.83 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  31.45 
 
 		 158 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  31.39 
 
 		 135 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  31.3 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  30.08 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  28.37 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  28.99 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  29.93 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  26.72 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  28.81 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>