43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1646 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  42.74 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  39.42 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  40.44 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  37.72 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  37.78 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  42.02 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  33.33 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  33.33 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  32.33 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  26.76 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  31.45 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30.34 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  27.97 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  32.14 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  25.4 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  32.17 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  25.4 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  26.47 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  27.97 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  28.07 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  26.21 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  29.32 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  32.17 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  31.9 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  28.26 
 
 		 145 aa  43.9  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  35.96 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  32.17 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  30.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  26.76 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  32.14 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  28.15 
 
 		 138 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>