61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3100 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  37.23 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3152  hypothetical protein  51.39 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0152929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  32.84 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  35.25 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  35.25 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  32.85 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  33.57 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  34.59 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  36.76 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  28.78 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  35.56 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  31.88 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  32.12 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  29.41 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  34.31 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  31.43 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  31.11 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  33.58 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  28.47 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  31.4 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  30.15 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  27.01 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  29.5 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  27.82 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  39.62 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  29.5 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  27.93 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  33.8 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  27.21 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  30.5 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  29.2 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  27.48 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  30.94 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  27.78 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  30.4 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  29.06 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  27.34 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  27.94 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  29.92 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  28 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  25.93 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  27.14 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  29.1 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  26.95 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>