69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2180 on replicon NC_013386
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  100 
 
 
140 aa  276  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  35.77 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  34.07 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  37.68 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  34.29 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  34.29 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  32.84 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  32.84 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  38.97 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  38.81 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  37.68 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  36.69 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  37.31 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  32.84 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  34.35 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  36.23 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  31.91 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  32.86 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  34.26 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  32.59 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  29.37 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  32.87 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  28.67 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  31.47 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  35.9 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  31.58 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  30.88 
 
 
162 aa  50.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  32.14 
 
 
163 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  36.36 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  38.05 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  26.76 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  28.78 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  27.59 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  26.28 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  30.88 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  26.32 
 
 
140 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  30.43 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  32.87 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  30.56 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  26.32 
 
 
140 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  31.62 
 
 
139 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  27.59 
 
 
141 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  28.06 
 
 
146 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  29.17 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  30.17 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  33.1 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  28.68 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  35.34 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  29.41 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  30.99 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  30.7 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  30.28 
 
 
143 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  27.41 
 
 
140 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  26.96 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  28.08 
 
 
141 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  27.87 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  26.53 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  44 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  32.77 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  43.48 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  29.69 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>