49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4381 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  53.33 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  55.56 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  46.51 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  48.09 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  46.51 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  50.39 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  47.69 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  43.85 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  34.33 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  57.89 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  32.88 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  37.31 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  37.31 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  32.84 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  34.59 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  32.85 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  33.59 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  37.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  38.06 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  34.31 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  36.03 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  34.56 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  28.79 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  33.82 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  33.09 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  27.61 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  32.54 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  28.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  29.93 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  29.93 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  27.59 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  30.15 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  31.54 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  29.84 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  30.5 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  30.5 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  26.61 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  28.15 
 
 		 145 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>