16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0425 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 91 aa  187  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  64.71 
 
 		 136 aa  95.9  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  57.89 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  50.88 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  50.79 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  54.24 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  46.43 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  40.91 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  52.83 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  52.83 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  41.54 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  33.8 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  42.22 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  43.48 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>