75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0308 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  289  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  45.04 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  41.01 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  40.15 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  41.35 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  44.85 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  40.14 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  36.92 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  38.35 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  38.81 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  37.68 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  36.09 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  36.17 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  35.29 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  35.29 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  32.88 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.69 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  32.58 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  36.96 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  34.09 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  31.54 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  29.63 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  29.37 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  33.83 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  31.88 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  32.41 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  31.79 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  28.57 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  31.85 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  33.57 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  50 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  35.17 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  32.12 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  31.39 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  29.23 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  30.83 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  30.6 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  30.71 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  30.71 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  30.28 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  30.53 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  31.34 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  30.07 
 
 		 174 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  36.17 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  32.79 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  29.41 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30.82 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  31.37 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  32.37 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  32.37 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  30.22 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  30.2 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  30.2 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  31.25 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  28 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  28.08 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  30.83 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  31.91 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  29.08 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  28.91 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  29.71 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  29.05 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  27.13 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  29.52 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>