54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1769 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  38.64 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  40 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  35.66 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  35.66 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  34.81 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  34.88 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  33.72 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  32.84 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  40.91 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  34.09 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  29.55 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  29.08 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  28.33 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  27.5 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  29.5 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  22.56 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  29.51 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  29.46 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  29.63 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  30.43 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  29.75 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  28.93 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  28.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  27.59 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  33.33 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  28.07 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  28.91 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  34.35 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  26.98 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  21.9 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  28.33 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  27.63 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  25.22 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  27.83 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  28.38 
 
 		 137 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  25.66 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  28 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  26.23 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  26.23 
 
 		 165 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  26.23 
 
 		 165 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>