24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5186 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 
139 aa  269  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  89.93 
 
 
137 aa  242  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  34.19 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  34.35 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  33.93 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.63 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.63 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  33.93 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  27.87 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  25.22 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  29.82 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  27.83 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  27.83 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  32.14 
 
 
137 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  27.73 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  31.96 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  32.77 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  28.45 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  29.69 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  34.74 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  29.92 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  25.21 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  25.22 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.190348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>