49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1423 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  280  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  41.35 
 
 		 136 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  39.39 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  40.6 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  35.97 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  34.17 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  34.06 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  33.91 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  28.03 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  33.9 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  31.47 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  34.11 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  31.5 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  31.53 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  30.94 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  35.9 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  33.81 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  33.81 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  31.43 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  29.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  28.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  33.62 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  30.66 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  26.79 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  25.86 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  25.86 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  30.51 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  29.66 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  30.7 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  26.98 
 
 		 143 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  28.81 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  26.02 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  28.1 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  29.03 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  29.91 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  29.03 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>