75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2114 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  283  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  36.84 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  40.16 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  36.23 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  36.92 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  38.21 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  34.51 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  35.82 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  31.54 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  38.33 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  36.09 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  36.09 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  34.59 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  38.66 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  37.1 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  33.83 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  29.1 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  41.38 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  32 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  35.56 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  34.06 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  31.58 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  35.34 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  30.77 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  32.23 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  33.87 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3675  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  30.6 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.737936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  33.87 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  33.87 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  33.63 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  31.71 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  34.09 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  36.92 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  30.53 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  29.82 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  32.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6726  hypothetical protein  29.85 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.818296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  33.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  29.77 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  32.79 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  32.26 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  32.26 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  28.16 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  34.19 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  34.71 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  31.16 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  30.43 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  32.56 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  31.75 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  31.45 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  29.66 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  29.77 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2417  hypothetical protein  27.59 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.335483  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  27.91 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2018  putative nucleic acid-binding protein  27.68 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  26.89 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  29.27 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  30.16 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  36.49 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  31.45 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  32 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  28.68 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>