54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1868 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  100 
 
 		 144 aa  274  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  37.31 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  29.85 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  36.23 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  33.61 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  39.66 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  37.93 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  30.66 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  31.58 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  30.63 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  31.3 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  33.91 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  29.71 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  29.71 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  34.11 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5180  nucleic acid-binding protein contains PIN domain- like protein  32.82 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5186  Nucleotide binding protein PINc  34.35 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  32.76 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  33.33 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  31.75 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  37.5 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  34.15 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  27.19 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  27.19 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  30.95 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  32.74 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.58 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  30.82 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  38.3 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  27.64 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  32.35 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  32.37 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  27.61 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  37.14 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  34.56 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0312  hypothetical protein  28.76 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.635435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  31.85 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  29.71 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  35.4 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  32.19 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  27.82 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  33.1 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>