27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1737 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 
131 aa  263  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  34.17 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  31.3 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  35.4 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  35.4 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  32.77 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  38.95 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  32.74 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  28.99 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  28.81 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  29.2 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  28.81 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  29.2 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  23.62 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  26.36 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  24.24 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  28.33 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  23.64 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  28.79 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  27.83 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  26.92 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  25.66 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  25.66 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  25.4 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  29.66 
 
 
145 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>