24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0136 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  48.55 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  46.38 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  42.11 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  45.32 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  43.8 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  37.23 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  36.03 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 143 aa  85.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  46.59 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  32.59 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  29.31 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.12 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  30.17 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  47.92 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  28.17 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  30.33 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  25.4 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  25.71 
 
 		 134 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  43.75 
 
 		 191 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>