26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2883 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  53.33 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  53.33 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  50.37 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  47.06 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  41.3 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  34.06 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  33.81 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  31.16 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  32.59 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  31.94 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  37.78 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.58 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  29.5 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  44 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  39.66 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  26.96 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  28.95 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  23.74 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  32.67 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>