67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0924 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  52.86 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  43.7 
 
 		 134 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  91.3  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  42.74 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  34.31 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  31.58 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  33.81 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  34.25 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  30.56 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  31.11 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  30.3 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  29.85 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  31.85 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  30.37 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  27.21 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  27.64 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  26.62 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  26.62 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  24.64 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  28.15 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  28.68 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  27.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  25.87 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  28.47 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  27.27 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  34.67 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  28.79 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  28.06 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  31.29 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  28.78 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  28.1 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  28.87 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  28.19 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  27.68 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1737  Nucleotide binding protein PINc  24.24 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  28.17 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  29.84 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  30.15 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  47.92 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  29.27 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3152  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0152929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  28.78 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  28.78 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  29.93 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  28.95 
 
 		 179 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  25.74 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  25.74 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  28.78 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  24.49 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  29.63 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  24.64 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  27.03 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>