24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1975 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  260  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0036  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000398667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  39.69 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  33.81 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  33.08 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  28.26 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.78 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.78 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30.88 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  28.68 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  25.83 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  27.86 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  28.78 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  28.06 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  24.82 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  24.82 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  30 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  28.03 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.93 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  28.93 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>