42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3977 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  90.58 
 
 		 191 aa  357  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  48.39 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  47.85 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  49.17 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  49.46 
 
 		 190 aa  165  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  47.59 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  45.98 
 
 		 189 aa  160  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  48.37 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  48.59 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  46.41 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  46.41 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  42.22 
 
 		 192 aa  151  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  42.78 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  40.66 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  37.78 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  41.15 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  43.85 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  37.23 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  39.18 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  43.41 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  42.64 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  31.61 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  38.51 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  41.09 
 
 		 180 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  41.09 
 
 		 180 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  38.81 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  39.33 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  39.11 
 
 		 186 aa  85.1  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  38.93 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  34.39 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  31.06 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  56.82 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  49.02 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  47.92 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  46 
 
 		 141 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  47.92 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  55.81 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>