60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2248 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 165 aa  323  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  98.79 
 
 		 165 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  98.79 
 
 		 165 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  94.3 
 
 		 159 aa  296  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  89.7 
 
 		 165 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  89.7 
 
 		 165 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  90.54 
 
 		 165 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  77.46 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  74.03 
 
 		 165 aa  217  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  74.69 
 
 		 165 aa  204  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  56.74 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  72.73 
 
 		 222 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  54.05 
 
 		 179 aa  123  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  53.95 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  50.65 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  51.66 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  70.45 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  75 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  75 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  75 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  75 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  75 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  43.55 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  36.71 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  43.8 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  38.62 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  42.4 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  43.2 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  41.09 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  36.71 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  40.94 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  38.28 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  37.88 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  31.93 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  36.13 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  31.67 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  32.06 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  34.51 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  31.3 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  28.35 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.45 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  29.51 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  30.77 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  32.39 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.88 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  34.56 
 
 		 143 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  26.67 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.23 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.11 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.11 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.23 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  33.83 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  26.23 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  30.51 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>