57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0094 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  58.87 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  58.7 
 
 		 140 aa  151  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  44.92 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  38.35 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  38.21 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  34.56 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  36.03 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  37.12 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  39.42 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  37.41 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  36.75 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  37.59 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  39.39 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  32.85 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  34.85 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  30.88 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  38.98 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  34.25 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  32.87 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  31.21 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  31.11 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  31.11 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  33.82 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  33.82 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  28.26 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  29.63 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  28.15 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  32.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  32.06 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  35.9 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3268  hypothetical protein  30.25 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  36.03 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  31.43 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  29.75 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  31.67 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  29.63 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  29.63 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  28.8 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  32.14 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  35.96 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  25.52 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  31.43 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0506  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0731238  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1054  hypothetical protein  29.21 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  26.67 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 162 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>