77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3147 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  298  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  54.81 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  53.68 
 
 
138 aa  140  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  54.41 
 
 
142 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  53.33 
 
 
147 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  54.07 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  44.85 
 
 
143 aa  105  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  36.23 
 
 
163 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  37.04 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  39.42 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  38.35 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  42.03 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  38.06 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  43.08 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  33.1 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  33.1 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  35.61 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  31.91 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  36.92 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  38.85 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  36.81 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  39.26 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  31.01 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  30.99 
 
 
174 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  35.42 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  34.35 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  38.06 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  31.82 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  32.37 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  35.34 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  35.34 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  34.06 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  30.28 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  32.58 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  32.12 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  34.45 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  32.12 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  30.65 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  33.58 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  32.37 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  32.37 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  31.43 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  30.37 
 
 
140 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  32.37 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  31.43 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  31.43 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  32.5 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  32.03 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  33.79 
 
 
161 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  31.06 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  33.82 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  29.41 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  35.59 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  29.2 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  32.41 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  46.55 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  32.41 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  30.56 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  32.37 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  32.37 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  30.51 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  32.85 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  29.2 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  37.8 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  31.58 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  28.48 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  35.82 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  26.15 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  28.89 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25150  hypothetical protein  57.89 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  27.14 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>