58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2858 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 136 aa  269  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  48.09 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  46.67 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  46.67 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  47.29 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  51.54 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  42.31 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  42.11 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  45.74 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  35.82 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  38.81 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  36.73 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  36.69 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  50.88 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  37.23 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  37.96 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  30.66 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  34.06 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  35.25 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  37.04 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  36.44 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  32.86 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  30.66 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  33.81 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  32.48 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  34.43 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  34.43 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  32.33 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  25.35 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  34.11 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2421  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2333  hypothetical protein  33.59 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  29.63 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  28.68 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  34.06 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  25.56 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  31.5 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  27.54 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  27.07 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  27.07 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  25.87 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  28.1 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  28.8 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  30.56 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  29.51 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 136 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 136 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  33.66 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  26.67 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  33.04 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>