48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0780 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  66.15 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  61.54 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  55.56 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  51.88 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  51.49 
 
 		 161 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  54.92 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  43.9 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  40.16 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  41.94 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  39.84 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  42.37 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  40.65 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  37.9 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  37.7 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  42.24 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  40.48 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  38.52 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  36.89 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  38.52 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  33.87 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  36.89 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  39.52 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  36.8 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  38.4 
 
 		 165 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  39.2 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  35.25 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  35.82 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  34.88 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  32.31 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  32.29 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  30.56 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  35.59 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  31.15 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  29.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  30.58 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  26.61 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  33.93 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  33.93 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  29.37 
 
 		 140 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>