60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2010 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  313  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  81.65 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  80.38 
 
 		 174 aa  245  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  59.44 
 
 		 174 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  60.14 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  52.63 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  52.5 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  52.5 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  52.74 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  54 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  52.94 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  55 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  53.74 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  53.74 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  51.7 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  57.5 
 
 		 222 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  45.59 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  43.31 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  48.28 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  55.7 
 
 		 210 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  55.7 
 
 		 210 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  57.14 
 
 		 210 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  55.7 
 
 		 210 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  55.7 
 
 		 210 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  43.94 
 
 		 136 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  42.54 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  45.86 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  55.84 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  46.51 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  42.75 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  46.51 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  35.97 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  36.13 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  35.43 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  36.43 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.37 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  33.86 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  30.16 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  30.34 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  32.03 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  38.14 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  33.79 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  23.97 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  30.07 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  29.92 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  29.92 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  32.26 
 
 		 136 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  29.86 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0730  PilT protein domain protein  27.4 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0759  PilT protein domain protein  27.4 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0937288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  26.9 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  30.95 
 
 		 139 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  27.97 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  29.1 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>