51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1013 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  347  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  79.41 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  52.47 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  53.74 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  54.72 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  56.43 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  59.44 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  54.09 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  54.67 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  55 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  55.8 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  52.03 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  52.03 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  55 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  55 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  42.76 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  45.97 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  56.79 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  40.94 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  59.72 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  55 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  55 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  55 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  55 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  60 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  40.71 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  37.18 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  41.54 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  43.94 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  42.19 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  37.91 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  37.24 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  37.93 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  37.9 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  34.71 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  29.66 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  27.4 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  32.65 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  30.99 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  26.71 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  30.89 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  28.67 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  28.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  28.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  27.59 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  26.9 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  26.53 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>