41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4483 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  269  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  77.44 
 
 		 147 aa  209  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  66.15 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  58.52 
 
 		 161 aa  150  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  59.26 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  56.91 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  58.33 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  42.86 
 
 		 174 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  40.94 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  42.14 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  38.71 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  41.98 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  39.84 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  42.42 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  41.27 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  39.39 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  38.64 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  38.64 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  38.64 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  40.31 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  38.64 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  37.98 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  37.98 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  37.01 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  36.07 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  32.54 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  39.37 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  34.07 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  45.61 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  47.27 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  43.86 
 
 		 225 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  29.7 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  33.65 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  30.58 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>