54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3181 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  327  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  87.88 
 
 		 165 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  86.23 
 
 		 171 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  77.12 
 
 		 159 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  74.69 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  77.03 
 
 		 165 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  76.47 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  76.47 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  71.34 
 
 		 165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  71.34 
 
 		 165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  56.83 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  53.9 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  49.1 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  50.98 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  54.42 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  73.17 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  71.76 
 
 		 222 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  73.97 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  73.97 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  73.97 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  73.97 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  73.97 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  45.59 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  43.55 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  44.03 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  39.29 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  41.27 
 
 		 136 aa  72  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  37.67 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  40.94 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  35.82 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  40.48 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  32.77 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  34.13 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  34.71 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  36.84 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  34.51 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  30.71 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  28.93 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  36.84 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  29.75 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  31.51 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  28.12 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  27.05 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  28.08 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  25.83 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  29.79 
 
 		 134 aa  43.9  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  27.27 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  27.27 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  31.43 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  29.57 
 
 		 146 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>