53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2165 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 174 aa  337  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  96.55 
 
 		 174 aa  310  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  81.65 
 
 		 161 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  54.72 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  56.41 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  51.27 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  51.27 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  52.38 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  50.99 
 
 		 165 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  53.47 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  54.55 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  52.35 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  52.82 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  52.82 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  49.1 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  44.29 
 
 		 136 aa  90.9  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  58.62 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  46.94 
 
 		 145 aa  87.4  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  59.74 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  59.74 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  59.74 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  59.74 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  59.74 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  43.18 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  59.74 
 
 		 225 aa  84.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  43.17 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  46.62 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  45.74 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  42.06 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  36.49 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  43.51 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  37.58 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  37.58 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  45.74 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  36.57 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  34.38 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  31.16 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  29.03 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  28.86 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  35.54 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  28.38 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  42.03 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  28.47 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  33.06 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  32.26 
 
 		 136 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  26.4 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  22.54 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  26.4 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  21.77 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>