53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2887 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  45.19 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  47.06 
 
 		 165 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  45.59 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  44.44 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  45.19 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  43.7 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  43.7 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  45.97 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  43.7 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  43.7 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  44 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  38.71 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  42.06 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  40.15 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  33.87 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  42.75 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  35.2 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  30.3 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  35.43 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  35.77 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  34.59 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  29.65 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  33.87 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  33.88 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  64.29 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  64.29 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  64.29 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  64.29 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  64.29 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  64.29 
 
 		 222 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  28.87 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  35.61 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  33.08 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  28.21 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  33.33 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  30.58 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  31.5 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  30.83 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  33.59 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  30.37 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  30.37 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  31.29 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2705  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 		 654 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000346209  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>