67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2655 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  292  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  75.54 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  67.63 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  53.24 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  48.48 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  54.81 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0232  hypothetical protein  33.62 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  33.09 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  32.37 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0094  protein of unknown function DUF132  36.03 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  33.82 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  33.8 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  34.59 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  31.93 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  27.4 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  35.11 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  32.09 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  32.09 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  35.04 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  31.09 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  31.09 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  28.87 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  30.25 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  30.25 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  32.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4274  PilT domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2942  PilT domain-containing protein  27.08 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.13795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2704  PilT domain-containing protein  27.08 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  29.91 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  32.14 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  29.2 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2867  nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  31.08 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  28.79 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1620  hypothetical protein  34.75 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1558  hypothetical protein  26.39 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3269  conserved hypothetical protein TIGR00305  31.29 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  30.43 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  28.77 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0942  PilT protein domain protein  28.81 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.510473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  27.01 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  29.17 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25150  hypothetical protein  51.02 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  26.28 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  29.86 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0110  hypothetical protein  27.94 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1975  hypothetical protein  28.47 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2206  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  42  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  32.31 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1057  hypothetical protein  26.55 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  29.87 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  29.87 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  29.87 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  29.87 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  29.87 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  30.58 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  24.64 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  21.99 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>